Balapan awal dihentikan setelah 17 lap karena hujan. Aturan diubah menjadi format flag-to-flag yang memungkinkan pembalap untuk menukar motor dengan ban yang berbeda selama balapan.
Penerapan pertama adalah dua tahun setelah Mugello di Phillip Island, dalam Grand Prix yang dimenangi oleh Marco Melandri.
Pada tahun yang sama, Troy Bayliss menangi Grand Prix terakhir di Valencia. Ini adalah pertama kalinya seorang Juara Dunia Superbike jadi pemenang balapan kelas utama.
Baca Juga: An Se-young Siap Tempur di Kejuaraan Dunia 2025 meski Cedera Lutut
Pada 2007, kapasitas mesin MotoGP dikurangi menjadi 800cc. Casey Stoner membubuhkan kemenangan pada balapan pertama musim itu di Qatar dengan mengendarai Ducati.
Setahun kemudian, pada Grand Prix ke-681, Lusail menggelar Grand Prix pertama yang digelar malam hari. Sebuah proposisi yang sangat berbeda dari Grand Prix pertama di Isle of Man 59 tahun sebelumnya.
Stoner kembali memenangi balapan untuk Ducati, yang diulanginya setahun kemudian dalam Grand Prix kelas premier pertama yang menggunakan aturan ban tunggal.
Baca Juga: LAFC Rekrut Son Heung-min, Winger Korea Jadi Rekan Setim Adrian Wibowo
Jorge Lorenzo memenangi Grand Prix ke-700 di Motegi pada 2009. Itu merupakan kemenangan MotoGP kedua bagi pembalap Spanyol tersebut. Kemenangan pertamanya diraih dalam 16 Grand Prix sebelumnya.
Setahun kemudian, Rossi memenangkan putaran pembuka di Qatar untuk memulai musim, yang mana para pembalap dibatasi menggunakan enam mesin sepanjang musim.
Pada balapan ke-750, Stoner memenangi Grand Prix terakhir dalam era 800cc untuk Honda di Valencia musim 2011.
Baca Juga: Jelang Laga Perdana Super League Pemain Persija Menyambangi Markas Jakmania
Lorenzo menang pada balapan pertama dalam era 1.000cc. Setahun kemudian pada 2013, Marc Marquez menjadi pemenang kelas utama termuda, dengan kemenangan untuk Honda di Circuit of the Americas. Itu baru balapan MotoGP keduanya.
Dalam event Grand Prix ke-795 di Sachsenring pada 2014, Bradley Smith finis posisi ke-19, hanya 56,293 detik di belakang pemenang balapan Marquez.
Itu adalah pertama kalinya dalam Grand Prix kelas utama, bahwa 19 pembalap pertama melewati garis finis di bawah satu menit.